研究人员调查35种癌症及相关真菌，构建首个泛癌症真菌生物群落图谱

在一项新的研究中，来自加州大学圣地亚哥分校和以色列魏茨曼科学研究所的研究人员调查了35种癌症及其相关真菌，并构建了首个泛癌症真菌生物群落图谱。相关研究成果于2022年9月29日发表在《细胞杂志》上，标题为“泛癌分析师揭示癌症类型特异性真菌生态和细菌相互作用“。

癌细胞与微生物有长期持久的关系。两者在人体的生态系统中共同进化，往往依赖相同的资源。对这些资源的竞争通常会影响癌细胞、微生物和人类宿主的复制和存活。

长期以来，人们一直在逐个研究癌症和个体微生物之间的关系，但最近，人们的注意力主要集中在整个人类微生物组上，特别是在肠道中，因为肠道中的细菌、病毒和真菌比人体其他部位的细菌、病毒和真菌越来越多。

然而，在很大程度上，癌症相关真菌的作用和影响尚未得到研究和了解。真菌是比病毒和细菌更复杂的生物。它们是真核生物——有细胞核的生物。与细菌或病毒相比，它们的细胞与动物的细胞非常相似。

论文合著者、加州大学圣地亚哥分校医学院儿科教授罗布奈特（Rob Knight）博士说，真菌存在于大多数人类癌症中，这既令人惊讶，也在意料之中。这令人惊讶，因为我们不知道真菌是如何进入全身肿瘤的。但这也是意料之中的，因为它符合全身（包括肠道、口腔和皮肤）健康微生物群的模式，其中细菌和真菌作为复杂社区的一部分相互作用。

人体内发现的真菌主要有两类：环境真菌，如酵母菌和霉菌，通常对大多数健康人无害；和共生真菌，它们生活在人体表面或内部，可能是无害的，提供如改善肠道健康的益处，或引起疾病，如酵母感染或肝病。真菌还在塑造宿主免疫力方面发挥作用，这在免疫功能低下的人群（包括癌症患者）中尤为突出。

这项新研究描述了来自四个独立队列的35种癌症的17，401份组织、血液和血浆样本中癌症真菌-癌症相关真菌的微生物组。这些作者发现，在许多主要的人类癌症中，真菌DNA和细胞的丰度非常低，并且在不同的癌症类型中，群落组成的差异是不同的。

论文的共同作者、魏茨曼科学研究所的Ravid Straussman博士说，真菌在人类肿瘤中普遍存在，这一发现应该促使我们更好地探索它们的潜在影响，并通过‘微生物组视角’重新审视我们对癌症的几乎所有知识。

将真菌群落与匹配的细菌群（微生物组的细菌部分）和免疫群（组成免疫系统的基因和蛋白质）进行比较的分析表明，它们之间的相关性往往是“容忍“而不是竞争。比如发现50岁以上患者乳腺癌肿瘤中富集一种真菌，而肺癌样本中明显富集另一种真菌。

这些作者表示，特定真菌与年龄、肿瘤亚型、吸烟状况、对免疫疗法的反应和生存措施之间存在明显的相关性。这些真菌是简单相关还是因果关系还有待确定。

该论文的第一作者、Micronoma公司的联合创始人兼首席分析师Gregory Sepich-Poore博士表示，这些发现验证了微生物组是整个癌症生物学的关键部分的观点，并可能带来重大的转型机会，不仅是在癌症检测方面，还包括与药物开发、癌症演变、最小残留疾病、复发和辅助诊断有关的其他生物技术应用。